1．探索中国近岸海海域有害藻华物种多样性 

　　  我国有害藻华物种藻种库的建立 

　　  我国有害藻华物种分子标记数据库构建 

　　  我国近岸海域有害藻华物种的生物多样性分析 

　　  中国近海藻华物种的地理分布以及时空动态变化研究 

　　2．探索有害藻华暴发规律和机理 

　　  典型有害藻华物种参考基因组的构建 

　　  典型有害藻华物种细胞器基因组的比较基因组研究 

　　  利用宏基因组学和宏转录组学技术研究藻华物种演替规律和机制 

　　  探索有害藻华暴发过程中环境因子的作用 

　　3．探索藻-菌-病毒互作在有害藻华暴发机制中的作用 

　　  系统分离有害藻华物种的重要共生菌 

　　  探索共生菌在有害藻华物种生活史中的作用 

　　  探索藻华暴发过程中藻-菌相互作用机制 

　　  探索藻华暴发过程中藻-菌-病毒相互作用机制 

　　4．探索有害藻华暴发的预测和防控 

　    开发用于跟踪有害藻华物种的高效能基因组技术 

　　  开发用于跟踪有害藻华物种共生菌的高效能基因组技术 

　　  开发用于近海海域，特别是养殖海域的有害藻华暴发防控预警技术