孙卫东主要从事海洋地质研究。在板块俯冲工厂和板块漂移历史及其驱动力方面有重要贡献。其代表性贡献是：(1)研究板块俯冲工厂，解决两个重要的科学悖论。a. “铼镱悖论”。准确测定了弧后盆海底火山岩玻璃和熔体包裹体中超微量元素的含量，发现未脱气的初始岩浆铼含量远远高于...
研究方向为海洋生态学，主要从事浮游动物种群动力学、海洋生态安全、极地和深海生态学研究。定量测定渤黄东海浮游动物对初级生产的摄食压力，揭示我国近海浮游动物关键种中华哲水蚤度夏种群的营养策略；提出并证实氮磷比失衡可以通过改变浮游植物饵料质量对浮游动物群落演替产...
主要从事大洋火成岩石学和地幔地球化学，主要研究兴趣包括：洋中脊岩浆作用和软流圈地幔动力学、全球板内海山成因和地幔组成化学均一性、板块俯冲有关的岩浆活动机制、南海扩张过程的岩浆作用和地幔组成，及岩浆过程中的深部碳循环研究等。主持/完成国家自然科学基金5项、主持/...
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