深海研究中心由海洋生物学、海洋生态学、海洋地质学、地球化学和海洋技术等多个学科的一线中青年科研人员组成。中心聚焦典型深海系统，以深海生态系统为突破口，理解生命起源、物种进化等重大科学问题。将海山、热液及冷泉等典型深海系统作为主要研究对象，开展地质过程-化学过程-生物过程的综合性研究。从海洋系统的角度，强调地学与生物学的耦合研究，强调极端环境对生物的制约以及特殊生命过程对极端环境的适应，注重科学与技术的融合，强调科学目标引领下的技术研发。以建成国际一流的深海研究数据平台、深海样品库和基因资源库为目标。