生物与医药

张琳琳,女,博士,研究员,博士生导师。2007年获中国海洋大学水产养殖学学士学位,2012年获中国科学院海洋研究所水产养殖学博士学位,随后分别于康奈尔大学和佛罗里达大学从事演化生物学博士后研究。2019年至今于中国科学院海洋研究所任课题组长,从事海洋无脊椎动物演化与环境适应研究。

    迄今共发表SCI 收录论文48 篇,累计引用次数超过4,700 次。其中以第一作者、共同第一作者或通讯作者的身份在Nature、Nature Communications、PNAS等国际主流杂志上发表23篇论文。相关研究被New York Times、The Atlantic 等著名第三方媒体宣传报道。获美国国家科学院院刊 Cozzarelli奖。

一、研究领域  

结合海洋科学调查、湿(实验)、干(大数据挖掘)的研究手段,聚焦于生物多样性丰富的海洋冠轮动物(贝类和多毛类等),以“基因编辑和功能适应性”为核心,从非模式动物功能遗传学体系构建(技术)、海洋生物对极端环境的功能适应性(机制)和重要基因资源利用(应用)三个层面研究海洋动物性状多样性的形成机制和基因资源利用。

目前开展的工作包括:

1. 海洋非模式动物基因编辑衍生技术的研发;

2. 深海大型底栖动物适应性性状的功能解析;

3. 海洋动物再生演化及其在再生医学方面的潜在价值;

4. 经济贝类基因编辑育种技术的研发及应用。     

二、招生专业及方向

1.博士及学术型硕士

   海洋生物学,繁殖、发育与调控技术方向

   海洋生物学,基因组学方向

   水产养殖学,养殖遗传学与育种生物技术方向

2.专业型硕士

   生物与医药,海洋生物工程方向

三、研究室及联系方式       

研究室:实验海洋生物学重点实验室

邮箱:linlinzhang@qdio.ac.cn

电话:0532-82896651;0532-82898875

四、承担的主要科研项目

(1)国家重点研发计划青年项目,贝虾基因编辑育种关键技术的研发与应用(2022YFD2401400),主持,2022年11月01日至2026年12月31日;

(2)国家自然科学基金面上项目,深海多鳞虫树枝状鳃的功能适应性研究(42376092),主持,2024年01月01日至2027年12月31日;

(3)国家自然科学基金面上项目,海洋底栖生物小头虫再生进化的分子机制(41976088),主持,2020年01月01日至2023年12月31日;

(4)中国科学院先导专项B子课题,典型生物的起源和演化机制,主持,2020年1月1日至2024年12月31日;

(5)青岛海洋科学与技术试点国家实验室, “十四五”重大项目课题,宏生物基因资源标准化收集与功能解析,子课题负责人,2022年05月01日至 2025年04月31日;

(6)深圳华大生命科学研究院开放基金,海洋多毛类再生演化的时空组学机制,2022年01月01日至2023年12月31日,主持。                    

五、研究成果及奖励      

发表SCI 收录论文48 篇,入选国家级和省部级人才称号,获得美国国家科学院院刊Cozzarelli奖(排名第1),山东省自然科学二等奖(排名第4)和中国海洋湖沼学会“张福绥贝类学奖”青年创新奖。   

六、代表性论文及著作

(1)Li, Y., Xue, Y., Peng, Z., & Zhang, L. * (2023). Immune diversity in lophotrochozoans, with a focus on recognition and effector systems. Computational and Structural Biotechnology Journal, 21:2262-2275.

(2) Yao, S., Chan, J., Xu, Y., Wu, S., & Zhang, L. * (2022). Divergences of the RLR Gene Families across Lophotrochozoans: Domain Grafting, Exon–Intron Structure, Expression, and Positive Selection. International journal of molecular sciences, 23(7), 3415. (被选为期刊Highlight推荐)

(3) Yao, S., Li, L., Guan, X., He, Y., Jouaux, A., Xu, F., Guo, X.*, Zhang, G.* & Zhang, L.* (2022) Pooled Resequencing of Larvae and Adults Reveals Genomic Variations Associated with Ostreid Herpesvirus 1 Resistance in the Pacific oyster Crassostrea gigas. Frontiers in Immunology, 10.3389/fimmu.2022.928628.

(4) Zhu, X., Mu, K., Wan, Y., & Zhang, L.* (2022). Evolutionary History of the NLR Gene Families Across Lophotrochozoans. Gene, 146807.

(5) Li, Q., Li, Y., Wang, Y., Wu, X., & Zhang, L.* (2022). Taxonomy and regeneration of a newly recorded Polychaete Capitella teleta (Annelida, Capitellidae) in the coastal water of Shandong, China. Journal of Oceanology and Limnology, 40(1), 309-321. (构建了始初小头虫的再生模型,被选为期刊Highlight推荐。)

(6) Chan, J. #, Zhang, W. #, Xu, Y., Xue, Y., & Zhang, L.* (2022). Electroporation-based CRISPR/Cas9 Mosaic Mutagenesis of β-tubulin in the Cultured Oyster. Frontiers in Marine Science, 10.3389/fmars.2022.912409. (论文在海洋经济贝类牡蛎中建立了基于电穿孔和长片段缺失镶嵌性突变的CRISPR/Cas9基因编辑平台,被中国科学院官网等报道。)

(7) Zhang, L., Mazo-Vargas, A. & Reed R.* (2017). A single master regulatory gene coordinates the evolution and development of butterfly color and iridescence. Proceedings of the National Academy of the USA, 114(40):10707-12. (论文系统阐述了图案形成的复杂调控网络,被选为封面文章,被Nature,纽约时报,大西洋月刊等报道评价)

(8) Zhang, L. & Reed R.D.* (2016). Genome editing in butterflies reveals that spalt promotes and Distal-less represses eyespot colour patterns. Nature Communications, 7, 11769. (论文证实了功能选配在演化新性状形成中的驱动力,为演化生物学教科书中基因选配的经典假说提供了实质性证据,相关成果被Science News, Science Daily等报道。)

(9) Zhang, L.*, Martin, A., Perry, M., van der Burg, K., Matsuoka, Y., Monteiro A.* & Reed R.* (2017). Genetic Basis of melanin pigmentation in butterfly wings. Genetics, 205(4):1537-1550. (论文开发了基于CRISPR/Cas9的长片段缺失镶嵌性突变技术。被选为封面文章和年度亮点推荐。)

(10) Zhang, G. *#, Fang, X. #, Guo, X. #, Li, L. #, Luo, R. #, Xu, F. #, Yang, P. #, Zhang, L. #, Wang, X. #, Qi, H., Xiong, Z., Que, H., Xie, Y., Holland W H, H., Paps, J., Zhu, Y., Wu, F., Chen, Y., Wang, J., Peng, C., Meng, J., Yang, L., Liu, J., Wen, B., Zhang, N., Huang, Z., Zhu, Q., Feng, Y., Mount, A., Hedgecock, D., Zhe, X., Liu, Y., Domazet Loso, T., Du, Y., Sun, X., Zhang, S., Liu, B., Cheng, P., Jiang, X., Li, J., Fan, D., Wang, W., Fu, W., Wang, T., Wang, B., Zhang, J., Peng, Z., Li, Y., Li, N., Wang, J., Cheng, M., He, Y., Tan, F., Song, X., Zheng, Q., Huang, R., Yang, H., Du, X., Chen, L., Yang, M., Gaffney, P.M., Wang, S., Luo, L., She, Z., Ming, Y., Huang, W., Zhang, S., Huang, B., Zhang, Y., Qu, T., Ni, P., Miao, G., Wang, J., Wang, Q.,  Steinberg, C.E.W., Wang, H., Li, N., Qian, L., Zhang, G., Li, Y., Yang, H., Liu, X., Wang., J., Yin, Y.* & Wang, J.*  (2012). The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. Nature, 490 (7418), 49-54. (# co-first author) (论文揭示了牡蛎生理防御系统在环境适应中的重要机制,被BBC,华盛顿邮报等报道。)

具体更新信息请参见实验室网页:

http://www.qdio.ac.cn/emblc/group/hyswyhyhjsy/yjzjs_51482/