海洋生物学

张琳琳,女,博士,研究员,博士生导师。2007年获中国海洋大学水产养殖学学士学位,2012年获中国科学院海洋研究所水产养殖学博士学位,随后分别于康奈尔大学和佛罗里达大学从事演化生物学博士后研究。2019年至今于中国科学院海洋研究所任课题组长,从事海洋无脊椎动物演化与环境适应研究。

迄今共发表SCI 收录论文39 篇,累计引用次数超过3,500 次。其中以第一作者、共同第一作者或通讯作者的身份在NatureNature CommunicationsPNAS等国际主流杂志上发表22篇论文。相关研究被New York TimesThe Atlantic 等著名第三方媒体宣传报道。获美国国家科学院院刊 Cozzarelli奖。

一、研究领域 

结合海洋科学调查、湿(实验)、干(大数据挖掘)的研究手段,聚焦于生物多样性丰富的海洋冠轮动物(贝类和多毛类等),以基因演化驱动动物环境适应的机制为核心,从动物性状形成的内在机制、环境驱动力和基因资源利用三个层面研究海洋动物适应性性状的分子机制和演化模式。

目前开展的工作包括:

1.海洋动物适应性性状形成的分子机制和演化途径;

2.海洋动物新性状地理格局的环境驱动效应(浅海和深海);

3.经济贝类基因编辑(CRISPR)等技术的开发及在水产育种中的应用;              

二、招生专业及方向

1.博士及学术型硕士

 海洋生物学,繁殖、发育与调控技术方向

 海洋生物学,基因组学方向

 水产养殖学,养殖遗传学与育种生物技术方向

2.专业型硕士

 生物与医药,海洋生物工程方向

三、研究室及联系方式      

研究室:实验海洋生物学重点实验室

邮箱:linlinzhang@qdio.ac.cn

电话:0532-828966510532-82898875

四、承担的主要科研项目

(1) 国家自然科学基金面上项目,海洋底栖生物小头虫再生进化的分子机制,2020/01-2023/12,主持;

(2) 中国科学院先导专项B子课题,典型生物的起源和演化机制,2020/01-2024/12,主持;

(3) 中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目,中国近海多毛类关键类群的分类鉴定和再生演化特征研究,2020/01-2022/12,主持; 

(4) 中国科学院和海洋研究所海外高层次引进人才配套启动经费,主持;   

(5) 深圳华大生命科学研究院开放基金,海洋多毛类再生演化的时空组学机制,2022/1-2023/12,主持。         

五、研究成果及奖励        

发表SCI 收录论文39 篇,入选国家级和省部级人才称号,获得美国国家科学院院刊Cozzarelli奖(排名第1),山东省自然科学二等奖(排名第4)和中国海洋湖沼学会张福绥贝类学奖青年创新奖。

六、代表性论文及著作

(1) Zhang, L., Mazo-Vargas, A. & Reed R.* (2017). A single master regulatory gene coordinates the evolution and development of butterfly color and iridescence. Proceedings of the National Academy of the USA, 114(40):10707-12. (论文系统阐述了图案形成的复杂调控网络,被选为封面文章,Nature,纽约时报,大西洋月刊等报道评价)

(2) Zhang, L. & Reed R.D.* (2016). Genome editing in butterflies reveals that spalt promotes and Distal-less represses eyespot colour patterns. Nature Communications, 7, 11769. (论文证实了功能选配在演化新性状形成中的驱动力,为演化生物学教科书中基因选配的经典假说提供了实质性证据,相关成果被Science News, Science Daily等报道。)

(3) Zhang, L.*, Martin, A., Perry, M., van der Burg, K., Matsuoka, Y., Monteiro A.* & Reed R.* (2017). Genetic Basis of melanin pigmentation in butterfly wings. Genetics, 205(4):1537-1550. (论文开发了基于CRISPR/Cas9的长片段缺失镶嵌性突变技术。被选为封面文章和年度亮点推荐。)

(4) Zhang, G. *#, Fang, X. #, Guo, X. #, Li, L. #, Luo, R. #, Xu, F. #, Yang, P. #, Zhang, L. #, Wang, X. #, Qi, H., Xiong, Z., Que, H., Xie, Y., Holland W H, H., Paps, J., Zhu, Y., Wu, F., Chen, Y., Wang, J., Peng, C., Meng, J., Yang, L., Liu, J., Wen, B., Zhang, N., Huang, Z., Zhu, Q., Feng, Y., Mount, A., Hedgecock, D., Zhe, X., Liu, Y., Domazet Loso, T., Du, Y., Sun, X., Zhang, S., Liu, B., Cheng, P., Jiang, X., Li, J., Fan, D., Wang, W., Fu, W., Wang, T., Wang, B., Zhang, J., Peng, Z., Li, Y., Li, N., Wang, J., Cheng, M., He, Y., Tan, F., Song, X., Zheng, Q., Huang, R., Yang, H., Du, X., Chen, L., Yang, M., Gaffney, P.M., Wang, S., Luo, L., She, Z., Ming, Y., Huang, W., Zhang, S., Huang, B., Zhang, Y., Qu, T., Ni, P., Miao, G., Wang, J., Wang, Q., Steinberg, C.E.W., Wang, H., Li, N., Qian, L., Zhang, G., Li, Y., Yang, H., Liu, X., Wang., J., Yin, Y.* & Wang, J.*  (2012). The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. Nature, 490 (7418), 49-54. (# co-first author) (论文揭示了牡蛎生理防御系统在环境适应中的重要机制,被BBC,华盛顿邮报等报道。)

(5) Zhang, L., Li, L., Guo, X.*, Litman, G. W.*, Dishaw, L. J., & Zhang, G.* (2015). Massive expansion and functional divergence of innate immune genes in a protostome. Scientific Reports, 5, 8693. (期刊年度引用前100)

(6) Yao, S., Chan, J., Xu, Y., Wu, S., & Zhang, L. * (2022). Divergences of the RLR Gene Families across Lophotrochozoans: Domain Grafting, Exon–Intron Structure, Expression, and Positive Selection. International journal of molecular sciences, 23(7), 3415. (被选为期刊Highlight推荐)

(7) Yao, S., Li, L., Guan, X., He, Y., Jouaux, A., Xu, F., Guo, X.*, Zhang, G.* & Zhang, L.* (2022) Pooled Resequencing of Larvae and Adults Reveals Genomic Variations Associated with Ostreid Herpesvirus 1 Resistance in the Pacific oyster Crassostrea gigas. Frontiers in Immunology, 10.3389/fimmu.2022.928628.

(8) Zhu, X., Mu, K., Wan, Y., & Zhang, L.* (2022). Evolutionary History of the NLR Gene Families Across Lophotrochozoans. Gene, 146807.

(9) Li, Q., Li, Y., Wang, Y., Wu, X., & Zhang, L.* (2022). Taxonomy and regeneration of a newly recorded Polychaete Capitella teleta (Annelida, Capitellidae) in the coastal water of Shandong, China. Journal of Oceanology and Limnology, 40(1), 309-321. (被选为期刊Highlight推荐)

(10) Chan, J. #, Zhang, W. #, Xu, Y., Xue, Y., & Zhang, L.* (2022). Electroporation-based CRISPR/Cas9 Mosaic Mutagenesis of β-tubulin in the Cultured Oyster. Frontiers in Marine Science, 10.3389/fmars.2022.912409. (论文在海洋经济贝类牡蛎中建立了基于电穿孔和长片段缺失镶嵌性突变的CRISPR/Cas9基因编辑平台,被中国科学院官网等报道。)

具体更新信息请参见实验室网页:

  http://www.qdio.ac.cn/emblc/group/hyswyhyhjsy/yjzjs_51482/