1. 刘瑞玉院士荣获“国际甲壳动物学会杰出研究贡献奖”。

2. 郑守仪院士荣获“山东省敬业奉献模范”称号。

3. 徐奎栋研究员荣获“第六届青岛市青年科技奖”。

2008年获奖：

1. 郑守仪院士荣获“青岛市关心下一代工作先进个人”称号。

2. 徐奎栋研究员荣获2008年“山东省第八届青年科技奖”。

2009年获奖：

1. 刘瑞玉院士荣获“青岛市科学技术最高奖”。

2. 郑守仪院士荣获“全国侨界十杰”称号，入选“山东省100位为新中国成立、建设做出突出贡献的英雄模范人物”（青岛市共12人）。

2010年获奖：

1. 徐奎栋研究员荣获“山东省有突出贡献的中青年专家”荣誉称号。

2012年获奖：

1. 徐奎栋研究员获“2012年山东省海外专业人士创新创业杰出成就奖”。

2. 李新正研究员获2012年中国海洋湖沼学会“优秀学会工作者”荣誉称号。

2013年获奖：

1. 徐奎栋研究员主持的“海洋微型底栖生物调查规范制定及多样性研究”获2012年国家海洋科学技术奖二等奖（海洋所排名第一；省部级）。

2. 类彦立研究员获国家海洋局海洋科学技术二等奖 “海洋微型底栖生物调查规范制定及多样性研究” （排名二；省部级）

2014年获奖：

1. 郑守仪院士荣获“青岛市科学技术最高奖”。

2. 类彦立研究员荣获瑞士日内瓦大学国际保罗布莱尼曼基金奖（Paul Br？nnimann Foundation）（排名一；国际奖励）。

3. 孙忠民副研究员荣获“中国洋湖沼学会先进个人奖”。

2016年奖励：

1. 沙忠利研究员荣获第4届曾呈奎海洋科技奖-青年科技奖。

2019年获奖：

1. 类彦立研究员荣获青岛市标准化资助奖励，2018年度标准化资助奖励专项资金项目主要完成人：类彦立（排名一；市级奖励）

2. 张振副研究员荣获“致公党优秀党员”。

3. 李新正研究员荣获山东省科协“山东省新时代优秀科普工作者”荣誉称号。