主持开展国家自然科学基金项目、科技部重点研发计划项目课题、中国科学院海洋战略先导专项、中国科学院青年拔尖科学家项目等30余项，部分如下：

(1)   国家自然科学基金共享航次计划科学考察项目“共享航次计划2023年度近海生态系统健康评估重大科学考察航次（航次编号：NORC2024-301）”（42349301），2024.1.1-2027.12.31， 600万元。

(2)   中国科学院“一带一路”国际科学组织联盟可持续发展研究计划项目“印度尼西亚可持续发展问题综合研究”(CAS-ANSO-SDRP-2024-02)，2024.9.24-2029.1.31，500万元。

(3)   国家自然科学基金杰出青年项目“海洋甲壳动物系统学”（42025603），2021.1-2025.12，400万元。

(4)   崂山实验室科技创新项目“深海生物多样性的多界面过程驱动机制与保护策略”（LSKJ202203100），2022.10-2025.9，1345.4万元。

(5)   国家重点研发计划项目课“南海珊瑚礁生态系统物种多样性格局及其维持机制”（2021YFF0502801），2022.4-2027.3，285万元。

(6)   国家自然科学基金创新群体项目“深海界面过程和化能生态系统”（42221005），2023.1.1-2027.12.31，100万元。

(7)   中国科学院A类战略性先导科技专项子课题“深海极端环境生物多样性的决定机制”（XDA22050302），2018.10-2023.9，488.53万元。

(8)   国家重点研发计划项目课题“热液动物基因组学与环境适应机制研究”（2018YFC0310702），2018.8-2021.12，573万元。

(9)   中国科学院前沿科学重点研究计划“深海大型生物物种多样性、起源与适应性研究”（QYZDB-SSW-DQC036），2017.5-2021.12，250万元。

(10)             “科学”号高端用户项目“深海化能生态系统中典型寄生动物的寄生机制研究”（KEXUE2019GZ02），2019.6-2021.12，180万元。