1）海洋动力与生态环境模拟与预报，海洋环境可预报性与目标观测；精细化海洋数值模式和再分析产品开发，物理-生态耦合模式开发，基于四维变分同化系统的人工智能模型及快速预报。

2）复杂地形影响下的海洋多尺度过程，包括岛链、陆坡、海槽等复杂地形影响西边界流的多尺度过程、机制和理论，大洋-近海相互作用过程及理论。

3）海洋和气候变率机理研究，气候变化条件下极地和近海环境变化和机制，ENSO和气候预测研究。