生物与医药
张德超,男,副研究员,硕士生导师,中国科学院大学岗位教授。20077月中国农业大学微生物学专业博士毕业;20078-20088月,中国海洋大学生命学院博士后;20089-20119月,奥地利因斯布鲁克大学微生物研究所从事博士后研究;201110月至今在中科院海洋所工作。以第一或通讯作者在Microbiome, mSystems, Science of the Total Environment, Applied and Environmental Microbiology, Microbial Ecology, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology等国际主流微生物学期刊发表SCI 论文69篇。目前为国际期刊《Frontiers in Marine Science》副主编(Associate Editor)。微生物授权发明专利2项(正式转化1项)。

一、研究领域 

海洋微生物多样性和适应机制,基因组信息学以及海洋微生物资源的应用

二、招生专业及方向

海洋生物学专业,生物与医药专业,海洋生物多样性与进化

三、研究室及联系方式

海洋生物分类与系统演化实验室,zhangdechao@qdio.ac.cn0532-82863656

四、承担的主要科研项目

[1].国家自然科学基金(青年)黄东海沉积物细菌的分类及多样性研究2013-2015

[2].国家自然科学基金(面上)微小杆菌属分类学及环境适应机制研究2017-2020

[3].中国科学院战略性先导科技专项子课题西太平洋海山区微生物分类和多样性研究2014-2018

[4].科技部基础性工作专项我国近海生物DNA条形码资源库构建子课题我国近海微生物DNA条形码资源库构建2014-2018

[5].科技部基础性工作专项西太平洋典型海山生态系统科学调查子课题海山区微生物多样性2017-2021

[6].饲用发酵鱼浆的开发和产业化(2020-2023

[7].青岛国家实验室十四五重大项目深海、极地微生物基因资源标准化收集与功能解析子课题(2022-2025

五、研究成果及奖励

[1].细菌分类领域。目前以第一作者或通讯作者公开发表和描述66个细菌的新种并建立了10个新属。

[2].特殊细菌类群适应机制。以全球分布的微小杆菌属为研究对象,首次揭示大部分发生扩张的转运蛋白家族与重要的生理代谢和环境胁迫抵抗有关,这些转运蛋白家族的选择性扩张可能是该属适应性进化的策略以及不同类群适应环境差异的决定因素。

[3].近海和深海水体中与氮循环相关的微生物多样性和代谢。分别以长江口和西北太平洋的水体为研究对象,采用分离培养、表型实验和基因组分析相结合,揭示水体中微生物在氮、硫和碳元素循环中的代谢作用。

[4].深海锰结核区微生物适应机制和代谢。通过对东太平洋锰结核沉积物进行深度宏基因组和功能基因解析,首次提出了微生物在金属、碳、氮和硫循环中的作用证据和生态的模型。该研究评为2023年中科院海洋所重大研究成果,被央视新闻等国内多家主流媒体宣传。

曾获国家海洋局2006年度极地优秀科技论文三等奖和2008年度极地优秀科技论文二等奖。作为主讲教师之一,讲授的《海洋生物多样性与进化》课程,荣获中国科学院大学2023年院级研究生优秀课程。

六、发表性论文

1. Zhang DC, Li X, Wu Y, Xu X, Liu Y, Shi B, Peng Y, Dai D, Sha Z, Zheng J. Microbe-driven elemental cycling enables microbial adaptation to deep-sea ferromanganese nodule sediment fields. Microbiome. 2023.11, 160. (中国科学院一区,IF=15.5)

2. Jiang ZC, Liu SZ, Zhang DC#, Sha, ZL. The diversity and metabolism of culturable nitrate-reducing bacteria from the photic zone of the Western North Pacific Ocean. Microbial Ecology. 2023. https://doi.org/10.1007/s00248-023-02284-w (JCR一区,IF=3.6)

3. He W, Liu S, Jiang Z, Zheng J, Li X#, Zhang DC#. The diversity and nitrogen metabolism of culturable nitrate-utilizing bacteria within the oxygen minimum zone of the Changjiang (Yangtze River) Estuary. Front. Mar. Sci. 2021. 8:720413. (JCR一区,IF=3.7)

4. Zhang DC, Zhu ZL, Li YJ, Li XD, Guan ZY, Zheng JS. Comparative genomics of Exiguobacterium reveals what makes a cosmopolitan bacterium. mSystems. 2021.6:e00383-21. (JCR一区,IF=6.4)

5. He WX, Li YJ, Zhang DC#. Pacificispira spongiicola gen. nov., sp. nov., a nitrate-reducing bacterium isolated from tropical western Pacific. Antonie van Leeuwenhoek. 2021.114, 2083-2090.

6. Dai DD, Li YJ, He WX, Qin F, Zheng JS, Sun M, Zhang DC#. Oceanomicrobium pacificus gen. nov., sp. nov., a member of the family Rhodobacteraceae isolated from seawater of tropical western Pacific. Antonie van Leeuwenhoek. 2021;114(3):303-311

7. Qin F, He WX, Zhang DC#. Marinisubtilis pacificus gen. nov., sp. nov., a member of the family Microbacteriaceae isolated from a deep-sea seamount. Curr Microbiol. 2021,78:2136-42

8. Wang Q, Liu F, Zhang DC#. Pelagihabitans pacificus gen. nov., sp. nov., a member of the family Flavobacteriaceae isolated from a deep-sea seamount. Int J Syst Evol Microbiol. 2020, 70(8):4569-4575.

9. Wang Q, Cai SD, Liu J, Zhang DC#. Aequorivita sinensis sp. nov., isolated from sediment of the East China Sea, and reclassification of Vitellibacter todarodis as Aquibacillus todarodis comb. nov. and Vitellibacter aquimaris as Aquibacillus aquimaris comb. nov. Int J Syst Evol Microbiol. 2020, 70(5),3323-3327.

10. Xiu P, Liu R, Zhang DC#, Sun CM#. Pumilacidin-like lipopeptides derived from marine bacterium bacillus sp. strain 176 suppress the motility of Vibrio alginolyticus. Applied and Environmental Microbiology. 2017 83:e00450-17.

11. Zhang DC#, Liu YX, Huang HJ, Neuner, K, Margesin R. Oceanihabitans sediminis gen. nov., sp. nov., a member of the family Flavobacteriaceae isolated from the Yellow Sea. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, 3400-3405.

12. Margesin R. Zhang DC. 2016. Alpinimonas. Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1–6.

13. Zhang DC, Margesin, R. Characterization of culturable heterotrophic bacteria in hydrocarbon-contaminated soil from an alpine former military site. World J Microbiol Biotechnol. 2014; 30(6), 1717-1724.

14. Zhang DC, Brouchkov A, Griva G, Schinner F, Margesin R. Isolation and Characterization of Bacteria from Ancient Siberian Permafrost Sediment. Biology. 2013; 2(1), 85-106.

15. Zhang DC, Mörtelmaier C, Margesin R. Characterization of the bacterial and archaeal diversity in hydrocarbon-contaminated soil. Science of the Total Environment. 2012; 184-196.