2004年本科毕业于中国海洋大学水产养殖系，后在中国科学院海洋研究所获得博士学位。美国普渡大学和英国牛津大学访问学者。2022年起任课题组长。先后主持国家自然科学基金、国家863重大项目课题、山东省自然科学基金、中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目等多项国家及省部级研究项目。在贝类基因组解析、神经内分泌系统演化、附着变态调控机制等方面取得原创性成果。以第一作者（含共同）或通讯作者在Nature，Nature Communications等国际期刊发表SCI论文20余篇。

一、研究领域  

结合比较基因组学、分子生物学等技术解析海洋贝类幼虫的适应性演化及发生机制，研究神经内分泌系统在贝类附着变态等典型生物学过程中的调控作用。研究内容紧密围绕贝类性状改良及人工调控，相关研究成果应用于水产养殖、海洋工程建筑等领域。主要研究方向包括：

1. 海洋无脊椎动物基因组学和演化发生学

2. 贝类附着变态机制及人工调控技术

3. 贝类遗传育种       

二、招生专业及方向

1.招生专业：海洋生物学，水产养殖学，生物与医药

2.招生方向：基因组学，繁殖、发育与调控技术，养殖遗传学与育种生物技术，海洋生物工程

三、研究室及联系方式       

实验海洋生物学重点实验室

邮箱：xufei@qdio.ac.cn

电话：0532-82898721  

四、承担的主要科研项目

1. 中国科学院海洋大科学研究中心，重点部署项目，COMS2019Q11，“海洋固着贝类粘附机制及人工调控技术研究”，2019/11-2022/11；

2. 国家自然科学基金面上项目，41776152，“牡蛎类胰岛素基因功能及转录调控机制研究”，2018/01-2021/12；

3. 国家自然科学基金青年项目，31402285，“长牡蛎章鱼胺受体的系统进化、信号转导及其在附着变态中的作用”，2015/01-2017/12； 

4. 国家863课题重大项目，2010AA10A110， “牡蛎全基因组测序与功能解析”，2010/01-2011/12；

5. 山东省自然科学青年基金项目，                           

五、研究成果及奖励         

在贝类和沙蚕等间接发育动物的幼虫进化机制及其理论探索方面取得原创性成果。针对海洋无脊椎动物由浮游到底栖生活的转变过程，在基因组学分析的基础上，深入验证相关基因调控网络，报道并命名了一个核受体新家族和11个bHLH转录因子新家族，揭示了担轮幼虫时期具有新基因高度表达的特点，证明了贝类担轮幼虫是其种系特征发育阶段（phylotypic stage）。发现胰岛素表达调控网络在动物演化历程中具有早期起源。针对贝类养殖中种质鉴定方法较少的情况，开发了基于分子生物学技术的贝类物种鉴定方法。以第一作者（含共同）在Nature, Nature Communications等国际期刊发表SCI论文30余篇，参编及编著书籍3部，授权发明专利9项，获省部级奖励两项。                           

六、代表性论文及著作

Xu F*, Marlétaz F, Gavriouchkina D, Liu X, Sauka-Spengler T, Zhang G, Holland P W H. 2021. Evidence from oyster suggests an ancient role for Pdx in regulating insulin gene expression in animals. Nature Communications, 12(1): 3117.

Zhang G#*, Fang X#, Guo X#*, Li L#, Luo R#, Xu F#, Yang P#, Zhang L#, Wang X#, Qi H, Xiong Z, Que H, Xie Y, Holland P W H, Paps J, Zhu Y, Wu F, Chen Y, Wang J, Peng C, Meng J, Yang L, Liu J, Wen B, Zhang N, Huang Z, Zhu Q, Feng Y, Mount A, Hedgecock D, Xu Z, Liu Y, Domazet-Lošo T, Du Y, Sun X, Zhang S, Liu B, Cheng P, Jiang X, Li J, Fan D, Wang W, Fu W, Wang T, Wang B, Zhang J, Peng Z, Li Y, Li N, Wang J, Chen M, He Y, Tan F, Song X, Zheng Q, Huang R, Yang H, Du X, Chen L, Yang M, Gaffney P M, Wang S, Luo L, She Z, Ming Y, Huang W, Zhang S, Huang B, Zhang Y, Qu T, Ni P, Miao G, Wang J, Wang Q, Steinberg C E W, Wang H, Li N, Qian L, Zhang G, Li Y, Yang H, Liu X, Wang J, Yin Y*, Wang J*. 2012. The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. Nature, 490: 49-54.

Xu F*, Gao T, Liu X. 2020. Metabolomics Adaptation of Juvenile Pacific Abalone Haliotis discus hannai to Heat Stress. Scientific Reports, 10(1): 6353.

Deng S#, Qu T#, Zhang G, Xu F*. 2023. Oyster studies reveal the duplication and functional diversification of Bivalvia caspase-8 genes. Journal of Oceanology and Limnology, 41(3): 1109-1121.

Bao Y, Xu F*, Shimeld S*. 2017. Phylogenetics of lophotrochozoan bHLH genes and the evolution of lineage-specific gene duplicates. Genome Biology and Evolution, 9(4): 869-886.

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Xu F, Domazet-Lošo T, Fan D, Dunwell T L, Li L, Fang X, Zhang G*. 2016. High expression of new genes in trochophore enlightening the ontogeny and evolution of trochozoans. Scientific Reports, 6: 34664.

Huang W#, Xu F#, Li J, Li L, Que H Y*, Zhang G F*. 2015. Evolution of a novel nuclear receptor subfamily with emphasis on the member from the Pacific oyster Crassostrea gigas. Gene, 567(2): 164-172.

Xu F, Wang X, Feng Y, Huang W, Wang W, Li L, Fang X, Que H, Zhang G*. 2014. Identification of Conserved and Novel MicroRNAs in the Pacific Oyster Crassostrea gigas by Deep Sequencing. PLoS ONE, 9(8): e104371.

Xu F, Zhang G*, Liu X, Zhang S, Shi B, Guo X*. 2009. Laboratory hybridization between Crassostrea ariakensis and C. Sikamea. Journal of Shellfish Research, 28(3): 453-458.

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