海洋生物学

张琳琳,博士,研究员,博士生导师,国家高层次引进青年人才。2007年获中国海洋大学水产养殖学学士学位,2012年获中国科学院海洋研究所水产养殖学博士学位,随后分别于康奈尔大学和佛罗里达大学从事演化生物学博士后研究。2019年至今任中国科学院海洋研究所研究组组长,2023年至今任实验海洋生物学实验室副主任,主要研究方向为海洋动物演化与设计育种。

累计发表SCI论文50余篇,其中以第一/通讯作者在Nature、PNAS、Nat. Commun.等发表论文29篇,他引6000余次。相关研究成果被New York Times、The Atlantic 等著名国际媒体宣传报道,并获美国国家科学院院刊 Cozzarelli奖。

一、研究领域 

实验室致力于:“探索海洋生命过程如何被环境塑造,其演化规律能否通过遗传改造加以利用?”为此,我们聚焦于生物多样性丰富的海洋冠轮动物(贝类和多毛类等),结合海洋科学调查、湿(实验)、干(大数据与AI)的研究手段,构建海洋非模式动物功能遗传学研究体系,解析海洋生命过程的演化机制,挖掘数亿年大自然演化积累的优异基因资源,并应用于水产种质创制,旨在开展从进化机制解析至种质创制应用的研究。目前实验室重点开展的工作包括:

1.冠轮动物演化发育生物学(再生、矿化);

2.深海冠轮动物的独特生命过程及其适应性演化机制;

3.水产冠轮动物(牡蛎和鲍鱼)基因编辑和智能设计育种关键技术研发。

二、招生专业及方向

1.博士及学术型硕士

海洋生物学,繁殖、发育与调控技术方向

海洋生物学,基因组学方向

水产养殖学,养殖遗传学与育种生物技术方向

2.专业型硕士

生物与医药,海洋生物工程方向

三、研究室及联系方式       

研究室:实验海洋生物学实验室

邮箱:linlinzhang@qdio.ac.cn

电话:0532-82896651

办公室:4号楼A403

四、承担的主要科研项目

(1)国家重点研发计划青年项目,贝虾基因编辑育种关键技术的研发与应用(2022YFD2401400),主持,2022年11月01日至2026年12月31日;

(2)国家自然科学基金面上项目,长牡蛎文石-方解石矿化演化的功能适应性研究(42576093),主持,2026年11月01日至2029年12月31日;

(3)国家自然科学基金面上项目,深海多鳞虫树枝状鳃的功能适应性研究(42376092),主持,2024年01月01日至2027年12月31日;

(4)国家自然科学基金面上项目,海洋底栖生物小头虫再生进化的分子机制(41976088),主持,2020年01月01日至2023年12月31日;

五、研究成果及奖励         

入选国家级青年、省部级中青年和省部级青年人才称号,获得美国国家科学院院刊Cozzarelli奖(排名第1),山东省自然科学二等奖(排名第4)和中国海洋湖沼学会“张福绥贝类学奖”青年创新奖(2019)。     

六、代表性论文及著作

(1) Chen, Y.#, Li J.#, Peng, Z., Lv, F., Wang, Y., Teng, W., Li, C. & Zhang, L.* (2026).  Comparative proteomics reveals conserved and lineage-specific molecular toolkits in lophotrochozoan biomineralization. Genome Biology and Evolution. (阐述了矿相对冠轮动物矿化基因募集的驱动效应)

(2) Weng, J.#, Wu, X#, Li, C. #, Li, Y. #, Li, Q., Dou, F., Wang, T., Li, J., Wang, Y. & Zhang, L.* (2025). Comprehensive dataset for Polychaetaes in the IPC: species, distribution, DNA barcodes, and functional traits. Scientific Data, 12:956.(构建了印太交汇区海域多毛类的功能性状数据库,Nature Research Life Sciences Community特邀团队撰写研究背后的故事“Behind the Paper”)

(3) Wang, Y. #, Wang, M. #, Li, J., Zhang, J. & Zhang, L.* (2024). A chromosome-level genome assembly of a deep-sea symbiotic aplacophoran mollusc Chaetoderma sp. (Mollusca: Caudofoveata). Scientific Data, 11:133.(构建了深海冷泉毛皮贝基因组,Nature Research Life Sciences Community特邀团队撰写研究背后的故事“Behind the Paper”)

(4) Li, R.#, Xu Y.#, Wu, F.#*, Peng Z., Chan J. & Zhang, L.* (2024). Easy-to-Use CRISPR/Cas9 Genome Editing in the Cultured Pacific Abalone (Halotis discus hannai). The CRISPR Journal, 7(1):41-52.(在鲍鱼中建立了适合养殖场场景的CRISPR/Cas9基因编辑技术)

(5) Chan, J. #, Zhang, W. #, Xu, Y., Xue, Y., & Zhang, L.* (2022). Electroporation-based CRISPR/Cas9 Mosaic Mutagenesis of β-tubulin in the Cultured Oyster. Frontiers in Marine Science, 10.3389/fmars.2022.912409. (在海洋经济贝类牡蛎中建立了基于电穿孔和长片段缺失镶嵌性突变的CRISPR/Cas9基因编辑技术,被中国科学院官网等报道。)

(6) Li, Q., Li, Y., Wang, Y., Wu, X., & Zhang, L.* (2022). Taxonomy and regeneration of a newly recorded Polychaete Capitella teleta (Annelida, Capitellidae) in the coastal water of Shandong, China. Journal of Oceanology and Limnology, 40(1), 309-321. (构建了始初小头虫的再生模型,被选为期刊Highlight推荐。)

(7) Zhang, L., Mazo-Vargas, A. & Reed R.* (2017). A single master regulatory gene coordinates the evolution and development of butterfly color and iridescence. Proceedings of the National Academy of the USA, 114(40):10707-12. (论文系统阐述了图案形成的复杂调控网络,被选为封面文章,被Nature,纽约时报,大西洋月刊等报道评价)

(8) Zhang, L. & Reed R.D.* (2016). Genome editing in butterflies reveals that spalt promotes and Distal-less represses eyespot colour patterns. Nature Communications, 7, 11769. (论文证实了功能选配在演化新性状形成中的驱动力,为演化生物学教科书中基因选配的经典假说提供了实质性证据,相关成果被Science News, Science Daily等报道。)

(9) Zhang, L.*, Martin, A., Perry, M., van der Burg, K., Matsuoka, Y., Monteiro A.* & Reed R.* (2017). Genetic Basis of melanin pigmentation in butterfly wings. Genetics, 205(4):1537-1550. (论文开发了基于CRISPR/Cas9的长片段缺失镶嵌性突变技术。被选为封面文章和年度亮点推荐。)

(10) Zhang, G. *#, Fang, X. #, Guo, X. #, Li, L. #, Luo, R. #, Xu, F. #, Yang, P. #, Zhang, L. #, Wang, X. #, Qi, H., Xiong, Z., Que, H., Xie, Y., Holland W H, H., Paps, J., Zhu, Y., Wu, F., Chen, Y., Wang, J., Peng, C., Meng, J., Yang, L., Liu, J., Wen, B., Zhang, N., Huang, Z., Zhu, Q., Feng, Y., Mount, A., Hedgecock, D., Zhe, X., Liu, Y., Domazet Loso, T., Du, Y., Sun, X., Zhang, S., Liu, B., Cheng, P., Jiang, X., Li, J., Fan, D., Wang, W., Fu, W., Wang, T., Wang, B., Zhang, J., Peng, Z., Li, Y., Li, N., Wang, J., Cheng, M., He, Y., Tan, F., Song, X., Zheng, Q., Huang, R., Yang, H., Du, X., Chen, L., Yang, M., Gaffney, P.M., Wang, S., Luo, L., She, Z., Ming, Y., Huang, W., Zhang, S., Huang, B., Zhang, Y., Qu, T., Ni, P., Miao, G., Wang, J., Wang, Q.,  Steinberg, C.E.W., Wang, H., Li, N., Qian, L., Zhang, G., Li, Y., Yang, H., Liu, X., Wang., J., Yin, Y.* & Wang, J.*  (2012). The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. Nature, 490 (7418), 49-54. (# co-first author) (论文揭示了牡蛎生理防御系统在环境适应中的重要机制,被BBC,华盛顿邮报等报道。)