海洋生物学
许飞,博士,中国科学院海洋研究所研究员。中国动物学会中国海洋湖沼学会贝类学分会理事兼副秘书长、山东动物学会常务理事。2004年毕业于中国海洋大学水产养殖系,后在中国科学院海洋研究所获得博士学位。美国Purdue University和英国Oxford University访问学者。主要从事海洋贝类遗传育种和进化发育生物学研究,在牡蛎基因组、贝类激素系统进化、附着变态调控机制等方面取得原创性成果。2017年入选中国科学院海洋研究所汇泉学者。
一、研究领域  
结合比较基因组学、分子生物学等技术解析海洋贝类幼虫的适应性进化及发生机制,研究激素系统在贝类附着变态等典型生物学过程中的调控作用。研究内容紧密围绕贝类性状改良及人工调控,相关研究成果应用于水产养殖、海洋工程建筑等领域。主要研究方向包括:
1.海洋无脊椎动物基因组学和进化发育生物学
2.贝类附着变态机制及人工调控技术
3.贝类遗传育种       
二、招生专业及方向
1.招生专业:海洋生物学,水产养殖学,生物与医药
2.招生方向:基因组学,繁殖、发育与调控技术,养殖遗传学与育种生物技术,海洋生物工程
三、研究室及联系方式       
实验海洋生物学重点实验室
邮箱:xufei@qdio.ac.cn  电话:0532-82898720  
四、承担的主要科研项目
1.中国科学院海洋大科学研究中心,重点部署项目,COMS2019Q11,“海洋固着贝类粘附机制及人工调控技术研究”,2019/11-2022/11;
2.国家自然科学基金面上项目,41776152,“牡蛎类胰岛素基因功能及转录调控机制研究”,2018/01-2021/12;
3.国家自然科学基金青年项目,31402285,“长牡蛎章鱼胺受体的系统进化、信号转导及其在附着变态中的作用”,2015/01-2017/12; 
4.国家863课题重大项目,2010AA10A110, “牡蛎全基因组测序与功能解析”,2010/01-2011/12;
5.山东省自然科学青年基金项目,ZR2010DQ024,“僧帽牡蛎与熊本牡蛎亲缘关系研究”,2010/11-2013/11。  
五、研究成果及奖励  
主持国家863重大项目课题,国家自然科学基金,中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目等5项。作为主要成员参加了国家973项目,国家自然基金重点项目等多项课题。在贝类和沙蚕等间接发育动物的幼虫进化机制及其理论探索方面取得原创性成果。针对海洋无脊椎动物由浮游到底栖生活的转变过程,在基因组学分析的基础上,深入验证相关基因调控网络,报道并命名了一个核受体新家族和11个bHLH转录因子新家族,揭示了担轮幼虫时期具有新基因高度表达的特点,证明了贝类担轮幼虫是其种系特征发育阶段(phylotypic stage)。发现胰岛素表达调控网络在动物演化历程中具有早期起源。针对贝类养殖中种质鉴定方法较少的情况,开发了基于分子生物学技术的贝类物种鉴定方法。以第一作者(含共同)在Nature, Nature Communications等国际期刊发表SCI论文30余篇,参编及编著书籍3部,授权发明专利9项,获省部级奖励两项。                           
六、代表性论文及著作
1.Xu F*, Marlétaz F, Gavriouchkina D, Liu X, Sauka-Spengler T, Zhang G, Holland P W H. 2021. Evidence from oyster suggests an ancient role for Pdx in regulating insulin gene expression in animals. Nat Commun, 12(1): 3117.
2.Xu F*, Gao T, Liu X. 2020. Metabolomics Adaptation of Juvenile Pacific Abalone Haliotis discus hannai to Heat Stress. Scientific Reports, 10(1): 6353.
3.Wei L#, Xu F#, Wang Y Z, Cai Z Q, Yu W C, He C, Jiang Q Y, Xu X Q, Guo W, Wang X T*. 2018. The Molecular Differentiation of Anatomically Paired Left and Right Mantles of the Pacific Oyster Crassostrea gigas. Mar. Biotechnol., 20(4): 425-435.
4.Bao Y, Xu F*, Shimeld S*. 2017. Phylogenetics of lophotrochozoan bHLH genes and the evolution of lineage-specific gene duplicates. Genome Biology and Evolution, 9(4): 869-886.
5.Ji P, Xu F*, Huang B, Li Y, Li L, Zhang G*. 2016. Molecular Characterization and Functional Analysis of a Putative Octopamine/Tyramine Receptor during the Developmental Stages of the Pacific Oyster, Crassostrea gigas. PLOS ONE, 11(12): e0168574.
6.Xu F, Domazet-Lošo T, Fan D, Dunwell T L, Li L, Fang X, Zhang G*. 2016. High expression of new genes in trochophore enlightening the ontogeny and evolution of trochozoans. Scientific Reports, 6: 34664.
7.Huang W#, Xu F#, Li J, Li L, Que H Y*, Zhang G F*. 2015. Evolution of a novel nuclear receptor subfamily with emphasis on the member from the Pacific oyster Crassostrea gigas. Gene, 567(2): 164-172.
8.Xu F, Wang X, Feng Y, Huang W, Wang W, Li L, Fang X, Que H, Zhang G*. 2014. Identification of Conserved and Novel MicroRNAs in the Pacific Oyster Crassostrea gigas by Deep Sequencing. PLoS ONE, 9(8): e104371.
9.Zhang G#*, Fang X#, Guo X#*, Li L#, Luo R#, Xu F#, Yang P#, Zhang L#, Wang X#, Qi H, Xiong Z, Que H, Xie Y, Holland P W H, Paps J, Zhu Y, Wu F, Chen Y, Wang J, Peng C, Meng J, Yang L, Liu J, Wen B, Zhang N, Huang Z, Zhu Q, Feng Y, Mount A, Hedgecock D, Xu Z, Liu Y, Domazet-Lošo T, Du Y, Sun X, Zhang S, Liu B, Cheng P, Jiang X, Li J, Fan D, Wang W, Fu W, Wang T, Wang B, Zhang J, Peng Z, Li Y, Li N, Wang J, Chen M, He Y, Tan F, Song X, Zheng Q, Huang R, Yang H, Du X, Chen L, Yang M, Gaffney P M, Wang S, Luo L, She Z, Ming Y, Huang W, Zhang S, Huang B, Zhang Y, Qu T, Ni P, Miao G, Wang J, Wang Q, Steinberg C E W, Wang H, Li N, Qian L, Zhang G, Li Y, Yang H, Liu X, Wang J, Yin Y*, Wang J*. 2012. The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. Nature, 490: 49-54.
10.Xu F, Zhang G*, Liu X, Zhang S, Shi B, Guo X*. 2009. Laboratory hybridization between Crassostrea ariakensis and C. Sikamea. J. Shellfish Res., 28(3): 453-458.
11.杨梅, 许飞, 刘俊, 李莉, 张国范* 2015. 长牡蛎(Crassostrea gigas)Wnt4基因cDNA克隆与表达分析. 海洋与湖沼 46: 35-42.
12.王海艳, 郭希明, 许飞, 张素萍, 徐凤山, 张国范* 2009. 中国北方沿海“褶牡蛎” 的分类和订名. 海洋科学 33(10): 104-106.
13.许飞, 郑怀平, 张海滨, 刘晓, 张国范* 2008. 海湾扇贝“中科红”品种与普通养殖群体不同温度下早期性状的比较. 水产学报 32(6): 876-883.
14.张娜, 刘晓, 许飞, 吴富村, 郭希明, 李霞, 张国范* 2007. 辽宁沿海巨蛎属牡蛎的分布. 海洋科学. 31(9), 91-95.
15.许飞, 刘晓*, 张国范2007. 牡蛎壳腔容积的两种测量方法比较. 海洋科学31(7): 15-19.