海洋生态学
孙丽娜,女,19861月生,博士,研究员,博士生导师。入选山东省优秀青年科学基金项目,山东省泰山学者青年专家,中科院青年创新促进会会员,中国科学院海洋研究所汇泉青年学者等人才支持。先后赴澳大利亚The University of Queensland和美国Duke University开展学术研究与合作交流。迄今第一作者与通讯作者在PloS BiologyMolecular EcologyScience of the Total Environment等期刊发表文章40余篇,总引用次数2000多次。现任中国海洋学会海洋生物资源专业委员会副秘书长,任山东省青年联合会第十三届委员会委员以及山东省青年创新人才协会会员。

一、研究领域 

运用功能基因组学、实验生物学等分子生物学手段,聚焦于海参等棘皮动物的特殊生理行为如再生、排脏自切行为的演化与调控机制,并且关注于海参的优良性状的遗传解析与分子育种技术开发。          

二、招生专业及方向

海洋生态学,生物资源生态学与养殖生态学方向;或生物与医药方向。

三、研究室及联系方式      

中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室 邮箱:sunlina@qdio.ac.cn

电话:0532-82896096

四、承担的主要科研项目

主持国家级和省部级项目8项。

国家自然科学基金项目:棘皮动物可变结缔组织可塑性的遗传基础与调控机制

国家自然科学基金项目:基于单细胞RNA-Seq技术分析刺参肠道再生原基细胞的演化命运

国家自然科学基金项目:刺参再生的基因组特征解析与关键调控基因分析

国家自然科学基金项目:刺参消化道再生过程中microRNA对细胞外基质重建的调控作用                          

五、研究成果及奖励        

从事海参等棘皮动物特殊行为演化与遗传育种研究,开展了海参精准育种平台的构建与应用工作。以第一/通讯作者发表SCI文章40余篇,参与出版英文专著2部,中文专著6部,授权发明专利10余项。获得“第七届中国科学院沈阳分院优秀青年科技人才奖”,作为参与人获得山东省自然科学奖二等奖(2/5)等省部级奖励6项。                      

六、代表性论文及著作

1Huo, D., Liu S., Zhang L., Yang H. and Sun L.* (2024). Importance of the ECM–receptor interaction for adaptive response to hypoxia based on integrated transcription and translation analysis. Molecular Ecology: e17352.

2Jiang, C., Liu S., Yang Y., Cui W., Xu S., Rasoamananto I., Lavitra T., Zhang L. and Sun L. (2024). "Population genomic analysis reveals a polygenic sex determination system in Apostichopus japonicus." iScience 27: 110852.

3Su F., Huo D., Yang H. and Sun L. * (2024). CircRNA8388 functions as the sponge for miR-2392 during intestinal regeneration in sea cucumber Apostichopus japonicus. International Journal of Biological Macromolecules 274: 133302.

4Huo, D., Zhang L., Yang H. and Sun L.* (2023). Adaptation to hypoxic stress involves amino acid metabolism: A case in sea cucumber. Environmental Pollution: 121766.

5Sun L.*, Jiang C., Su F., Cui W., Yang H* (2023). Chromosome-level genome assembly of the sea cucumber Apostichopus japonicus. Scientific data 10: 454.

6Jiang, C., K. B. Storey, H. Yang and L. Sun* (2023). "Aestivation in Nature: Physiological Strategies and Evolutionary Adaptations in Hypometabolic States." International Journal of Molecular Sciences 24(18): 14093.

7H. Zhang, Q. Wang, J. Zhao, S. Liu, L. Zhang, Y. Zhao, H. Yang and L. Sun* (2020). Quantitative microbiome profiling links microbial community variation to the intestine regeneration rate of the sea cucumber Apostichopus japonicus. Genomics 112(6): 5012-5020.

8Sun, L., Lin C., Li X., Xing L., Huo D., Sun J., Zhang L. and Yang H. "Comparative Phospho- and Acetyl Proteomics Analysis of Posttranslational Modifications Regulating Intestine Regeneration in Sea Cucumbers." Frontiers in Physiology, 2018, 9: 836.

9Sun L., Sun J., Li X., Zhang L.*, Yang H., Wang Q.. Understanding Regulation of microRNAs on intestine regeneration in the Sea Cucumber Apostichopus japonicus using High-Throughput Sequencing. Comparative Biochemistry and Physiology D 2017, 22, 1-9.

10Zhang, X.#, L. Sun#, J. Yuan#, Y. Sun#, Y. Gao#, L. Zhang#, S. Li#, H. Dai, J.-F. Hamel, C. Liu, Y. Yu, S. Liu, W. Lin, K. Guo, S. Jin, P. Xu, K. B. Storey, P. Huan, T. Zhang, Y. Zhou, J. Zhang, C. Lin, X. Li, L. Xing, D. Huo, M. Sun, L. Wang, A. Mercier*, F. Li*, H. Yang* and J. Xiang*. "The sea cucumber genome provides insights into morphological evolution and visceral regeneration." PLOS Biology, 2017, 15(10): e2003790.