海洋生态学

刘进贤19783月生,博士,博士生导师,于中国海洋大学获得学士博士学位、先后在美国南卡罗莱纳大学和加州大学开展研究工作,入选中国科学院“百人计划”,青岛海洋科学与技术国家实验室‘鳌山人才’优秀青年学者,主持多项国家自然科学基金项目。从事海洋生物分子生态学研究,主要以海洋鱼类为研究对象,开展群体遗传学/基因组学研究,探讨海洋生物的群体演化历史、遗传结构及快速适应环境的遗传机制等。已在PNASMolecular Biology and Evolution, Molecular EcologyMolecular Ecology ResourcesMolecular Phylogenetics and EvolutionConservation GeneticsBiological Invasions等国际期刊发表SCI论文40余篇。

一、研究领域及方向

1.海洋生物群体遗传学及保护遗传学研究

由于过度捕捞及人类活动导致的环境恶化,中国沿海的海洋资源生物面临严峻的资源衰退和小型化等生态问题。采用分子遗传学手段,查明中国沿海资源生物的遗传多样性现状、评估进化潜力、阐明群体遗传结构和基因交流模式、种群动态变化模式等。 相关研究结果可为资源生物的管理和种群的保护提供科学依据。

2.海洋生物的适应性进化的分子机制

分子生物学技术的迅猛发展为研究非模式生物的适应性进化机制带来了契机。通过全基因组水平的遗传多样性研究,结合生态、生理、基因等多方面的综合,探讨海洋生物代表物种表型多样性的演变与环境适应的关系,进而探讨适应的遗传机制。

二、招生专业及方向

海洋生态学/生物资源生态学

三、承担科研项目情况

1、国家自然科学基金项目短吻新银鱼不同生态型适应性进化遗传机制的群体基因组学研究(42176133),2022/01-2025/12, 58.00万元,主持,在研。

2、国家自然科学基金项目,全球变化背景下西北太平洋短滨螺群体遗传结构及适应性进化研究(31970488),2020/01-2023/1258.00万元,主持,在研。

3、国家自然科学基金项目,基于简化基因组测序的日本鳗鲡种群遗传结构及本地适应性进化研究(41676137),2017/01-2020/12, 69.00万元,主持,结题。

4、国家自然科学基金项目,基于多组学解析松江鲈对环境变化的适应策略及机制(31972793),2020/01-2023/1258万元,参加,在研。

5、国家自然科学基金项目,脉红螺 Rapana venosa 雌性多次交配行为和精子竞争研究(31200280),2013.01-2015.1222.00万元,主持,结题。

6、中国科学院百人计划人才项目,中国近海海洋生物分子生态学研究,2012/01-2015/12200.00万元,主持。

7、青岛海洋科学与技术国家实验室“鳌山人才”优秀青年学者计划,(2015ASTP-ES05, 2015/01-2017/12, 150.00万元,主持。

四、代表性论文、著作(*为通讯作者)

1Dong-Xiu Xue, Teng-Fei Xing, Jin-Xian Liu*. 2022. A high-quality chromosome-level genome of the endangered roughskin sculpin provides insights into its evolution and adaptation. Molecular Ecology Resources, DOI: 10.1111/1755-0998.13582.

2Shao-Bing Zong, Yu-Long Li, Jin-Xian Liu*. 2021. Genomic architecture of rapid parallel adaptation to fresh water in a wild fish. Molecular Biology and Evolution, 38(4) 1317-1329.

3Yu-Qiang Li, Meng-Yu Li, Teng-Fei Xing, Jin-Xian Liu*. 2021. Resolving the origins of invertebrate colonists in the Yangtze River Estuary with molecular markers: Implications for ecological connectivity. Ecology and Evolution 11(20): 13898-13911.

4Yu-Long Li, Teng-Fei Xing, Jin-Xian Liu*. 2020. Genome-wide association analyses based on whole-genome sequencing of Protosalanx hyalocranius provide insights into sex determination of Salangid fishes. Molecular Ecology Resources, 20: 1038-1049.

5Yu-Long Li, Jin-Xian Liu*. 2018. StructureSelector: A web-based software to select and visualize the optimal number of clusters using multiple methods. Molecular Ecology Resources, 18(1):176-177.

6Yu-Long Li, Dong-Xiu Xue, Bai-Dong Zhang, Jin-Xian Liu*. 2019. Population genomic signatures of genetic structure and environmental selection in the catadromous roughskin sculpin Trachidermus fasciatus. Genome Biology and Evolution, 11, 1751–1764.

7Dong-Xiu Xue, Graves J, Carranza A, Sylantyev S, Snigirov S, Tao Zhang, Jin-Xian Liu*. 2018. Successful worldwide invasion of the veined rapa whelk, Rapana venosa, despite a dramatic genetic bottleneck. Biological Invasions, 20 (11) 3297-3314.

8Jin-Xian Liu*, Tatarenkov A, Beacham T, Gorbachev V, Wildes S, Avise JC. 2011 Effects of Pleistocene climatic fluctuations on the phylogeographic and demographic histories of Pacific Herring (Clupea pallasii). Molecular Ecology, 20, 3879-3893.

9Jin-Xian Liu, Ely B*. 2009. Sibship reconstruction demonstrates the extremely low effective population size of striped bass Morone saxatilis in the Santee-Cooper system, South Carolina, USA. Molecular Ecology, 18, 4112-4120.

10、Jin-Xian Liu, Tian-Xiang Gao, Shi-Fang Wu, Ya-Ping Zhang*. 2007. Pleistocene isolation in the Northwestern Pacific marginal seas and limited dispersal in a marine fish, Chelon haematocheilus (Temminck & Schlegel, 1845). Molecular Ecology, 16, 275-288.

五、联系方式

海洋生态与环境科学重点实验室,电话:0532-82898909;电子邮件:jxliu@qdio.ac.cn