许飞，男，博士，研究员，博士生导师，山东省泰山学者青年专家。主要从事海洋贝类遗传育种和进化发育生物学研究。在贝类基因组解析、神经内分泌系统演化、附着变态调控机制等方面取得原创性成果。先后主持国家自然科学基金、国家863重大项目课题等多项国家及省部级研究项目。相关成果以第一作者（含共同）或通讯作者在Nature，Nature Communications等国际期刊发表。现任山东动物学会常务理事、中国动物学会和中国海洋湖沼学会贝类学分会常务委员兼秘书长。

一、研究领域 

结合比较基因组学、分子生物学等技术解析海洋贝类幼虫的适应性演化及发生机制，研究神经内分泌系统在贝类附着变态等典型生物学过程中的调控作用。研究内容紧密围绕贝类性状改良及人工调控，相关研究成果应用于水产养殖、海洋工程建筑等领域。主要研究方向包括：

1.海洋无脊椎动物基因组学和演化发生学

2.贝类附着变态机制及人工调控技术

3.贝类遗传育种

二、招生专业及方向

1.招生专业：海洋生物学，水产养殖学，生物与医药

2.招生方向：基因组学，繁殖、发育与调控技术，养殖遗传学与育种生物技术，海洋生物工程

三、研究室及联系方式      

研究室：实验海洋生物学重点实验室

邮箱：xufei@qdio.ac.cn

电话：0532-82898721 

四、承担的主要科研项目

1.中国科学院基础与交叉前沿科研先导专项，XDB0730200，“牡蛎疱疹病重要病毒病原的感染与免疫机制”子课题，2023.12-2028.11，100万元，在研；

2.国家重点研发计划，2022YFD2401200，“北部湾陆海接力智慧渔场养殖装备与新模式”子课题，2022.11-2026.12，35万元，在研；

3.崂山实验室科技创新项目，LSKJ202203001，“贝类环境适应机制相关研究”子课题，2022.10-2025.9，50万元，在研；

4.山东省人才项目，tsqn202211250，“牡蛎附着变态基因调控网络研究”，2022.7-2025.6，37.5万元，在研；

5.光合基金，ghfund202107020949，“第三代基因组测序数据组装机评价软件的部署及应用”，2万元，主持，已结题；

6.中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目，COMS2019Q11，“海洋固着贝类粘附机制及人工调控技术研究”，2019/11-2022/11，120万元，主持，已结题；

7.国家自然科学基金面上项目，41776152，“牡蛎类胰岛素基因功能及转录调控机制研究”，2018/01-2021/12，62万元，已结题；

8.国家自然科学基金青年项目，31402285，“长牡蛎章鱼胺受体的系统进化、信号转导及其在附着变态中的作用”，2015/01-2017/12，25万元，已结题；

9.国家863课题重大项目课题，2010AA10A110， “牡蛎全基因组测序与功能解析”，2010/01-2011/12，676万元，已结题；

10.山东省自然科学青年基金项目，ZR2010DQ024，“僧帽牡蛎与熊本牡蛎亲缘关系研究”，2010/11-2013/11，5万元，已结题。            

五、研究成果及奖励        

在贝类和沙蚕等间接发育海洋动物的幼虫进化机制及其理论探索方面取得原创性成果。针对海洋无脊椎动物由浮游到底栖生活的转变过程，在基因组学分析的基础上，深入验证相关基因调控网络，报道并命名了一个核受体新家族和11个bHLH转录因子新家族，揭示了担轮幼虫时期具有新基因高度表达的特点，证明了贝类担轮幼虫是其种系特征发育阶段（phylotypic stage）。发现胰岛素表达调控网络在动物演化历程中具有早期起源。针对贝类养殖中种质鉴定方法较少的情况，开发了基于分子生物学技术的贝类物种鉴定方法。

相关成果以第一作者（含共同）在Nature, Nature Communications等国际期刊发表，参编及编著书籍3部，授权发明专利10项，获山东省自然科学二等奖、山东省科技进步一等奖，海洋科学技术奖一等奖等奖励。

六、代表性论文及著作

1.Xu F*, Deng S, Gavriouchkina D, Zhang G. 2023. Transcriptional regulation analysis reveals the complexity of metamorphosis in the Pacific oyster (Crassostrea gigas). Marine Life Science & Technology, 5(4): 467-477.

2.Xu F*, Marlétaz F, Gavriouchkina D, Liu X, Sauka-Spengler T, Zhang G, Holland P W H. 2021. Evidence from oyster suggests an ancient role for Pdx in regulating insulin gene expression in animals. Nature Communications, 12(1): 3117.

3.Xu F*, Gao T, Liu X. 2020. Metabolomics Adaptation of Juvenile Pacific Abalone Haliotis discus hannai to Heat Stress. Scientific Reports, 10(1): 6353.

4.Wei L#, Xu F#, Wang Y Z, Cai Z Q, Yu W C, He C, Jiang Q Y, Xu X Q, Guo W, Wang X T*. 2018. The Molecular Differentiation of Anatomically Paired Left and Right Mantles of the Pacific Oyster Crassostrea gigas. Mar. Biotechnol., 20(4): 425-435.

5.Bao Y, Xu F*, Shimeld S*. 2017. Phylogenetics of lophotrochozoan bHLH genes and the evolution of lineage-specific gene duplicates. Genome Biology and Evolution, 9(4): 869-886.

6.Xu F, Domazet-Lošo T, Fan D, Dunwell T L, Li L, Fang X, Zhang G*. 2016. High expression of new genes in trochophore enlightening the ontogeny and evolution of trochozoans. Scientific Reports, 6: 34664.

7.Huang W#, Xu F#, Li J, Li L, Que H Y*, Zhang G F*. 2015. Evolution of a novel nuclear receptor subfamily with emphasis on the member from the Pacific oyster Crassostrea gigas. Gene, 567(2): 164-172.

8.Xu F, Wang X, Feng Y, Huang W, Wang W, Li L, Fang X, Que H, Zhang G*. 2014. Identification of Conserved and Novel MicroRNAs in the Pacific Oyster Crassostrea gigas by Deep Sequencing. PLoS ONE, 9(8): e104371.

9.Zhang G#*, Fang X#, Guo X#*, Li L#, Luo R#, Xu F#, Yang P#, Zhang L#, Wang X#, Qi H, Xiong Z, Que H, Xie Y, Holland P W H, Paps J, Zhu Y, Wu F, Chen Y, Wang J, Peng C, Meng J, Yang L, Liu J, Wen B, Zhang N, Huang Z, Zhu Q, Feng Y, Mount A, Hedgecock D, Xu Z, Liu Y, Domazet-Lošo T, Du Y, Sun X, Zhang S, Liu B, Cheng P, Jiang X, Li J, Fan D, Wang W, Fu W, Wang T, Wang B, Zhang J, Peng Z, Li Y, Li N, Wang J, Chen M, He Y, Tan F, Song X, Zheng Q, Huang R, Yang H, Du X, Chen L, Yang M, Gaffney P M, Wang S, Luo L, She Z, Ming Y, Huang W, Zhang S, Huang B, Zhang Y, Qu T, Ni P, Miao G, Wang J, Wang Q, Steinberg C E W, Wang H, Li N, Qian L, Zhang G, Li Y, Yang H, Liu X, Wang J, Yin Y*, Wang J*. 2012. The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. Nature, 490: 49-54.

10.Xu F, Zhang G*, Liu X, Zhang S, Shi B, Guo X*. 2009. Laboratory hybridization between Crassostrea ariakensis and C. Sikamea. J. Shellfish Res., 28(3): 453-458.