海洋生态学
刘进贤,1978年3月生,博士,博士生导师,于中国海洋大学获得学士博士学位、先后在美国南卡罗莱纳大学和加州大学开展研究工作,入选中国科学院“百人计划”,持国家重点研发专项课题及多项国家自然科学基金项目。从事海洋生物多样性与演化相关研究,以海洋生物(主要为海洋鱼类)为对象,解析生物多样性形成与维持机制,揭示多样性及适应性进化的遗传机制,研发海洋生物多样性监测保护关键技术。已在PNAS、Current Biology, Molecular Biology and Evolution, Molecular Ecology、Molecular Ecology Resources等国际期刊发表SCI论文60余篇。
一、研究领域  
1.海洋生物群体遗传学及保护遗传学研究
由于过度捕捞及人类活动导致的环境恶化,中国沿海的海洋资源生物面临严峻的资源衰退和小型化等生态问题。采用分子遗传学手段,查明中国沿海资源生物的遗传多样性现状、评估进化潜力、阐明群体遗传结构和基因交流模式、种群动态变化模式等。 相关研究结果可为资源生物的管理和种群的保护提供科学依据。
2.海洋生物的适应性进化的分子机制
分子生物学技术的迅猛发展为研究非模式生物的适应性进化机制带来了契机。通过比较基因组分析,结合生态、生理、基因等多方面的综合,探讨海洋生物代表物种表型多样性的演变与环境适应的关系,进而探讨适应的遗传机制以及表型多样性创新的遗传基础。               
二、招生专业及方向
海洋生态学/生物资源生态学
三、研究室及联系方式       
海洋生态与环境科学重点实验室,电话:0532-82898909;电子邮件:jxliu@qdio.ac.cn  
四、承担的主要科研项目
1、国家重点研发计划项目课题:近海生态质量监测评估与环境分区管控关键技术-基于环境DNA 的近海生物多样性调查技术研究(课题编号:2023YFC3108001),2023/12-2026/11,190万元,主持,在研。
2、国家自然科学基金项目, 短吻新银鱼不同生态型适应性进化遗传机制的群体基因组学研究(42176133),2022/01-2025/12, 58.00万元,主持,在研。
3、国家自然科学基金项目,全球变化背景下西北太平洋短滨螺群体遗传结构及适应性进化研究(31970488),2020/01-2023/12,58.00万元,主持,结题。
4、国家自然科学基金项目,基于简化基因组测序的日本鳗鲡种群遗传结构及本地适应性进化研究(41676137),2017/01-2020/12, 69.00万元,主持,结题。
5、国家自然科学基金项目,脉红螺 Rapana venosa 雌性多次交配行为和精子竞争研究(31200280),2013.01-2015.12,22.00万元,主持,结题。
6、中国科学院百人计划人才项目,中国近海海洋生物分子生态学研究,2012/01-2015/12,200.00万元,主持,结题。        
五、代表性论文及著作
1、Yu-Long Li, Teng-Fei Xing, Hao Yang, H. William Detrich III, Jin-Xian Liu. 2025. Independent evolutionary deterioration of the oxygen-transport system in Asian noodlefishes and Antarctic icefishes. Current Biology, 35(13): 3133-3145(一区top,Q1,封面亮点文章)
2、Hao Yang, Yu-Long Li, Teng-Fei Xing, Jian-Hui Wu, Ting Wang, Ming-Sheng Zhu, Jin-Xian Liu. 2025. Genome-wide Parallelism Underlies Rapid Freshwater Adaptation Fueled by Standing Genetic Variation in a Wild Fish. Molecular Biology and Evolution, 42(7), msaf160, https://doi.org/10.1093/molbev/msaf160(一区top,Q1) 
3、Teng-Fei Xing, Yu-Long Li, Hao Yang, Deborah Charlesworth, Jin-Xian Liu. 2025. Extensive recombination suppression and genetic degeneration of a young ZW sex chromosome system in halfbeak fish. Molecular Biology and Evolution, 42(7), msaf151, doi: 10.1093/molbev/msaf151.(一区top,Q1)
4、Dong-Xiu Xue, Teng-Fei Xing, Jin-Xian Liu*. 2022. A high-quality chromosome-level genome of the endangered roughskin sculpin provides insights into its evolution and adaptation. Molecular Ecology Resources, DOI: 10.1111/1755-0998.13582.
5、Shao-Bing Zong, Yu-Long Li, Jin-Xian Liu*. 2021. Genomic architecture of rapid parallel adaptation to fresh water in a wild fish. Molecular Biology and Evolution, 38(4) 1317-1329. (一区top,Q1)
6、Yu-Long Li, Teng-Fei Xing, Jin-Xian Liu*. 2020. Genome-wide association analyses based on whole-genome sequencing of Protosalanx hyalocranius provide insights into sex determination of Salangid fishes. Molecular Ecology Resources, 20: 1038-1049.
7、Yu-Long Li, Jin-Xian Liu*. 2018. StructureSelector: A web-based software to select and visualize the optimal number of clusters using multiple methods. Molecular Ecology Resources, 18(1):176-177.
8、Jin-Xian Liu*, Tatarenkov A, Beacham T, Gorbachev V, Wildes S, Avise JC. 2011 Effects of Pleistocene climatic fluctuations on the phylogeographic and demographic histories of Pacific Herring (Clupea pallasii). Molecular Ecology, 20, 3879-3893.
9、Jin-Xian Liu, Ely B*. 2009. Sibship reconstruction demonstrates the extremely low effective population size of striped bass Morone saxatilis in the Santee-Cooper system, South Carolina, USA. Molecular Ecology, 18, 4112-4120.
10、Jin-Xian Liu, Tian-Xiang Gao, Shi-Fang Wu, Ya-Ping Zhang*. 2007. Pleistocene isolation in the Northwestern Pacific marginal seas and limited dispersal in a marine fish, Chelon haematocheilus (Temminck & Schlegel, 1845). Molecular Ecology, 16, 275-288.