1.船舶运维部主任全面负责船舶中心的船舶运行维护、财务和岸基人员的管理。

2.海务部负责船舶中心海务管理工，监督、检查船舶的安全与防污染；负责船舶的运行与调度；对船舶运行维护工作提供岸基支持。

3.机务部负责船舶中心机务管理工作，监督，检查船舶防污染工作；对船舶设备及管理工作检查，指导；负责航修、坞修工作；对船舶备品备件监督、审核、审批；对船舶运行维护工作提供岸基支持。

4.船员部负责船舶中心船员管理工作，负责船员证书、证件的办理和管理工作；负责涉及安全和防污染工作的船员培训工作。

5.船舶是安全管理的执行层，船长在船舶中心的领导下，负责船舶安全和防污染管理工作；对船舶具有安全和防污染管理的绝对责任和权力；是船舶安全和环境保护的第一责任人。